（1）水生态研究

水生态文明建设与流域生态保护

河湖生态健康评价与调控

海绵城市与水资源承载力研究

（2）水安全研究

水安全战略与“一带一路”研究

水安全评价与调控

水安全、粮食安全与能源安全关系研究

（3）水灾害研究

水灾害演变机理分析与实验研究

水灾害监测预警与风险评估

水灾害风险调控与防控

（4）生态文明制度研究

生态补偿制度研究

生态系统生产总值（GEP）核算研究

水权、碳汇、排污权制度研究

绿色金融政策研究

生态+绿色产业发展研究

新安江指数研究

（5）大江大河水问题研究

大江大河水资源问题研究

大江大河水环境问题研究

大江大河水生态问题研究

大江大河水灾害问题研究